組蛋白
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組蛋白（histones）真核生物體細胞染色質(zhì)中的堿性蛋白質(zhì)，含精氨酸和賴氨酸等堿性氨基酸特別多，二者加起來約為所有氨基酸殘基的1/4。組蛋白與帶負電荷的雙螺旋DNA結(jié)合成DNA-組蛋白復(fù)合物。因氨基酸成分和分子量不同，主要分成5類。組蛋白是真核生物染色體的基本結(jié)構(gòu)蛋白,是一類小分子堿性蛋白質(zhì),有五種類型：H1、H2A、H2B、H3、H4，它們富含帶正電荷的堿性氨基酸,能夠同DNA中帶負電荷的磷酸基團相互作用。
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簡介
histone
是指所有真核生物的細胞核中，與DNA結(jié)合存在的堿性蛋白質(zhì)的總稱。分子量約10 000～20 000。
真核生物體細胞染色質(zhì)中的堿性蛋白質(zhì)，含精氨酸和賴氨酸等堿性氨基酸特別多，二者加起來約為所有氨基酸殘基的1/4。組蛋白與帶負電荷的雙螺旋DNA結(jié)合成DNA-組蛋白復(fù)合物。因氨基酸成分和分子量不同，主要分成5類。
組蛋白的甲基化修飾主要是由一類含有SET結(jié)構(gòu)域的蛋白來執(zhí)行的，組蛋白甲基化修飾參與異染色質(zhì)形成、基因印記、X染色體失活和轉(zhuǎn)錄調(diào)控等多種主要生理功能，組蛋白的修飾作用是表觀遺傳學(xué)研究的一個重要領(lǐng)域。組蛋白甲基化的異常與腫瘤發(fā)生等多種人類疾病相關(guān)，可以特異性地激活或者抑制基因的轉(zhuǎn)錄活性。研究發(fā)現(xiàn)，組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶的作用對象不僅僅限于組蛋白，某些非組蛋白也可以被組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶甲基化，這將為探明細胞內(nèi)部基因轉(zhuǎn)錄、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、甚至個體的發(fā)育和分化機制提供更廣闊的空間?！ ?/p>
概述
組蛋白的基因非常保守。親緣關(guān)系較遠的種屬中,四種組蛋白(H2A、H2A、H3、H4)氨基酸序列都非常相似,如海膽組織H3的氨基酸序列與來自小牛胸腺的H3的氨基酸序列間只有一個氨基酸的差異,小牛胸腺的H3的氨基酸序列與豌豆的H3也只有4個氨基酸不同。不同生物的H1序列變化較大,在某些組織中,H1被特殊的組蛋白所取代。如成熟的魚類和鳥類的紅細胞中H1則被H5所取代,精細胞中則由精蛋白代替組蛋白。染色質(zhì)中的組蛋白與DNA的含量之比為1:1。
真核生物細胞核中組蛋白的含量約為每克DNA 1克，大部分真核生物中有5種組蛋白，兩棲類、魚類和鳥類還有H5以替代或補充H1。染色質(zhì)是由許多核小體組成的，H2A，H2B，H3和H4各2個分子構(gòu)成的8聚體是核小體的核心部分，H1的作用是與線形 DNA結(jié)合以幫助后者形成高級結(jié)構(gòu)。組蛋白是已知蛋白質(zhì)中最保守的，例如，人類和豌豆的H4氨基酸序列只有兩個不同，人類和酵母的H4氨基酸序列也只有8個不同，這說明H4的氨基酸序列在約109年間幾乎是恒定的。早在1888年德國化學(xué)家科塞（A.Kossel）已從細胞核中分離出組蛋白，并認識到它們作為堿性物質(zhì)應(yīng)在核中與核酸結(jié)合，但直到1974年才了解組蛋白的確切作用。一些實驗室隨后證明組蛋白以獨特的方式構(gòu)成核小體的組分?！ ?/p>
組蛋白-組成部分
組蛋白是存在于染色體內(nèi)的與DNA結(jié)合的堿性蛋白質(zhì)，染色體中組蛋白以外的蛋白質(zhì)成分稱非組蛋
白。絕大部分非組蛋白呈酸性，因此也稱酸性蛋白質(zhì)或剩余蛋白質(zhì)。組蛋白于1834年由德國科學(xué)家A.科塞爾發(fā)現(xiàn)。組蛋白對染色體的結(jié)構(gòu)起重要的作用。染色體是由重復(fù)單位──核小體組成。每一核小體包括一個核心8聚體（由4種核心組蛋白H2A、H2B、H3和H4的各兩個單體組成）；長度約為200個堿基對的脫氧核糖核酸(DNA)；和一個單體組蛋白H1。長度約為140個堿基對的DNA盤繞于核心8聚體外面。在核心8聚體之間則由長度約為60個堿基對的DNA連接。這種DNA稱為“接頭”DNA。
幾乎所有真核細胞染色體的組蛋白均可分成5種主要的組分，分別用字母或數(shù)字命名，命名方法也不統(tǒng)一，如H1或稱F1，Ⅰ;H2A或稱F2A2，Ⅱb1；H2B或稱F2B，Ⅱb2；H3或稱F3，Ⅲ；H4或稱F2A1，Ⅳ。有核的紅細胞或個別生物體中，還存在特別的組蛋白成分，紅細胞中為H5或F2C，Ⅴ，鮭魚組織中為H6或T。H2A、H2B、H3、H4組成核小體的核心，也稱核心組蛋白。根據(jù)組蛋白的一級結(jié)構(gòu)，又可將它們分為3種類型:賴氨酸含量特別豐富的組蛋白(H1);賴氨酸含量較豐富的組蛋白（H2A和H2B）;精氨酸含量豐富的組蛋白（H3和H4）。從整體來說，組蛋白在進化過程中保守性很強。其中H1變化較大，H3和H4變化最小。如對小牛胸腺的5種組蛋白，豌豆苗組蛋白的H3、H4和兔胸腺組蛋白H1等的一級結(jié)構(gòu)比較中發(fā)現(xiàn)，小牛胸腺和豌豆苗的組蛋白H4間只在60位和77位上的兩個氨基酸殘基不同。但已知的真菌和原生動物的組蛋白的部分一級結(jié)構(gòu)和動、植物的組蛋白間的差異較大?！ ?/p>
合成修飾
這是形成組蛋白各組分不均一性的主要原因。修飾的方式有：①乙酰化。有兩種，一種是H1、H2A、H4組蛋白的氨基末端乙酰化，形成α-乙酰絲氨酸，組蛋白在細胞質(zhì)內(nèi)合成后輸入細胞核之前發(fā)生這一修飾。二是在H2A、H2B、H3、H4的氨基末端區(qū)域的某些專一位置形成N6-乙酰賴氨酸。②磷酸化。所有組蛋白的組分均能磷酸化，在細胞分裂期間，H1的1～3個絲氨酸可以磷酸化。而在有絲分裂時期，H1有3～6個絲氨酸或蘇氨酸發(fā)生磷酸化，其他四個核心組蛋白的磷酸化可以發(fā)生在氨基末端區(qū)域的絲氨酸殘基上。組蛋白的磷酸化可能會改變組蛋白與DNA的結(jié)合。③甲基化。僅發(fā)現(xiàn)于H3的9和27位和H4的20位的賴氨酸，鴨紅細胞組蛋白H1和H5的組氨酸。④ADP-核糖基化。組蛋白H1、H2A、H2B及H3和多聚ADP-核糖的共價結(jié)合，ADP-核糖基化被認為是在真核細胞內(nèi)啟動復(fù)制過程的扳機。
H3.H4的乙?；纱蜷_一個開放的染色質(zhì)結(jié)構(gòu),增加基因的表達。轉(zhuǎn)錄共同激活物如CBP?P300、PCAF實質(zhì)上是體內(nèi)的組蛋白乙?；?/a>轉(zhuǎn)移酶(HAT)。相反,HDAC參與組成轉(zhuǎn)錄共同抑制復(fù)合物,已發(fā)現(xiàn)的兩個共同抑制復(fù)合物SIN3、Mi22NHRD(核小體重塑蛋白去乙?；?都含有HDAC1、HDAC2。SIN3的組成為核心(HDAC1、HDAC2、RBAP46?RBAP48)SIN3A?SIN3B、SAP30?SAP18共同構(gòu)成。SIN3復(fù)合物通過組分SIN3A與序列特異性轉(zhuǎn)錄因子或共同抑制物包括mael2max,核激素受體N2COR?SMRT、甲基化CPG粘附蛋白(NECP2、MBD2)相互作用。Mi22NHRD由核心(HDAC1、HDAC2、RBAP46?RBAP48)Mi2、MTA1?MTA2、MBD3組成,其中MBD3含有MBD樣序列,與甲基化DNA有低親和力,分析發(fā)現(xiàn)MBD3與甲基化有關(guān)的氨基酸被置換,由此推測MBD3與MBD2相互作用而使Mi22NURD與甲基化DNA結(jié)合。由此看出,DNA甲基化和組蛋白去乙阻遏。此外,Mi22NURD還有染色質(zhì)重塑活性,所以SIN3和Mi22NURD可能分別在長期和短期轉(zhuǎn)錄阻遏調(diào)節(jié)中起作用。
在哺乳動物基因組中,組蛋白則可以有很多修飾形式.一個核小體由兩個H2A,兩個H2B,兩個H3,兩個H4組成的八聚體和147bp纏繞在外面的DNA組成.組成核小體的組蛋白的核心部分狀態(tài)大致是均一的,游離在外的N-端則可以受到各種各樣的修飾,包括組蛋白末端的乙酰化,甲基化,磷酸化,泛素化等等。組蛋白被甲基化的位點是賴氨酸和精氨酸.賴氨酸可以分別被一、二、三甲基化,精氨酸只能被一、二甲基化.在組蛋白H3上，共有5個賴氨酸位點可以被甲基化修飾.一般來說,組蛋白H3K4的甲基化主要聚集在活躍轉(zhuǎn)錄的啟動子區(qū)域.組蛋白H3K9的甲基化同基因的轉(zhuǎn)錄抑制及異染色質(zhì)有關(guān).EZH2可以甲基化H3K27，導(dǎo)致相關(guān)基因的沉默，并且與X-Chromosomeinactivation相關(guān)。H3K36的甲基化同基因轉(zhuǎn)錄激活相關(guān)。
醫(yī)學(xué)應(yīng)用
預(yù)測前列腺癌
最新研究結(jié)果顯示：球形組蛋白修飾模式可預(yù)測低分級前列腺癌的復(fù)發(fā)危。該研究第一作者加利福尼亞大學(xué)的SiavashK.Kurdistani表示：這種修飾模式最終可作為前列腺或其他類型癌癥的預(yù)后或診斷指標，也可作為預(yù)測何種患者患者會對一類組蛋白去乙酰酶抑制劑新藥產(chǎn)生反應(yīng)的指標。Kurdistani解釋：某些組蛋白修飾模式會在一定水平上影響基因的表達，但具體機制尚不清楚。Kurdistani等人研究了五種組蛋白修飾模式，包括三種乙?；饔?，兩種二甲基化作用，用組織芯片技術(shù)對原發(fā)前列腺癌組織樣品中的組蛋白修飾水平進行檢測。研究者對104例Gleason評分小于7的樣本進行染色組蛋白修飾檢測，結(jié)果將研究對象分為兩組，第一組十年內(nèi)復(fù)發(fā)危險為17%，第二組為42%。該預(yù)測指標與腫瘤分期，術(shù)前PSA水平或是否包膜外侵犯相獨立。研究者對另外的39例低分級前列腺癌樣本的組蛋白修飾模式進行了確認，結(jié)果也分為兩組，一組的復(fù)發(fā)危險為4%，另一組為31%。研究者最后表示：考慮到組蛋白修飾模式的多樣性，其他組蛋白修飾位點的信息將有助于我們對患者進行進一步分類，包括那些高分極組的患者。應(yīng)用免役組化及越來越多的的抗體檢測組蛋白修飾將有助于這種檢測指標在其他腫瘤中的應(yīng)用?！ ?/p>
生物鐘的調(diào)控
組蛋白修飾與基因表達調(diào)控有關(guān)已經(jīng)被廣泛的證明了?，F(xiàn)在-PierreEtchegary，StevenReppertandcoworkers的研究表明組蛋白修飾，特別是組蛋白乙酰化對于哺乳動物生物鐘的調(diào)控是非常重要的。
調(diào)控生物鐘的關(guān)鍵蛋白Clock和Bmal1驅(qū)動著三個period基因（Per1，2，3）和兩個細胞色素基因（Cry1，2）的表達。這5個基因的轉(zhuǎn)錄本覆蓋了生物24小時的時間。但奇怪的是Clock/Bmal1對Per啟動子的結(jié)合相對穩(wěn)定，而它們對Cry1啟動子最強的結(jié)合卻反應(yīng)著Cry1表達的最弱。在這篇文章中E發(fā)現(xiàn)是染色體結(jié)構(gòu)的修飾來決定Per和Cry基因的轉(zhuǎn)錄的。
研究者用甲醛交連的染色體免疫沉淀CHIP和半定量的PCR反應(yīng)的方法發(fā)現(xiàn)在Per1和Per2的啟動子上組蛋白3的乙酰化在全天都存在，而RNA多聚酶II也一直被招募在這些啟動子上。當H3被乙酰化和RNA多聚酶II結(jié)合最強時，Per轉(zhuǎn)錄本水平最高，這說明H3的乙酰化可能通過促進將RNA多聚酶II招募到啟動子上而促進基因的轉(zhuǎn)錄。Cry基因座位的表達也有類似的相關(guān)性。
研究者發(fā)現(xiàn)具有蛋白質(zhì)乙?；钚缘膒300在小鼠肝細胞中能與Clock組成復(fù)合物。研究者認為白天p300/Bmal1/Clock結(jié)合在啟動子上，促進H3乙酰化，RNA多聚酶II招募到啟動子上而Per基因發(fā)生轉(zhuǎn)錄。夜間p300與Bmal1/Clock進行解離，導(dǎo)致組蛋白的去乙酰化而抑制基因的轉(zhuǎn)錄。那么導(dǎo)致p300基因日夜節(jié)律的是什么呢？研究者發(fā)現(xiàn)是Cry對其進行負調(diào)控的結(jié)果，研究者發(fā)現(xiàn)Cry1，2抑制p300/Bmal1/Clock驅(qū)動的基因轉(zhuǎn)錄。他們認為可能是Cry對p300/Bmal1/Clock復(fù)合物進行去穩(wěn)定性作用而對其功能進行抑制。乙酰化對基因表達的調(diào)控已經(jīng)廣為人知，這個新的研究更讓人們確定組蛋白的乙?；瘜虮磉_的調(diào)控具有很廣泛的作用。
成分
通常含有H1，H2A，H2B，H3，H4等5種成分。除H1外，其他4種組蛋白均分別以二聚體(共八聚體)相結(jié)合，形成核小體核心。DNA便纏繞在核小體的核心上。而H1則與核小體間的DNA結(jié)合。因此，一般認為組蛋白作為結(jié)構(gòu)支持體的作用比其基因調(diào)節(jié)作用更為重要。鳥類、兩棲類等含有細胞核的紅細胞中，含有一種叫H5的特殊組蛋白。此外，在停止增殖的細胞中，還含有一種叫H1°的組蛋白，H1°的結(jié)構(gòu)與H5相類似。組蛋白可受到甲基化、乙?；?、磷酸化、聚ADP核糖酰化，以及與泛醌(ubiquinone)相結(jié)合等幾種類型的修飾。組蛋白的修飾與染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的變化及基因活性控制的相關(guān)性等等，是今后的重要研究課題。
含量
真核生物細胞核中組蛋白的含量約為每克DNA 1克，大部分真核生物中有5種組蛋白，兩棲類、魚類和鳥類還有H5以替代或補充H1。染色質(zhì)是由許多核小體組成的，H2A，H2B，H3和H4各2個分子構(gòu)成的8聚體是核小體的核心部分，H1的作用是與線形 DNA結(jié)合以幫助后者形成高級結(jié)構(gòu)。組蛋白是已知蛋白質(zhì)中最保守的，例如，人類和豌豆的H4氨基酸序列只有兩個不同，人類和酵母的H4氨基酸序列也只有8個不同，這說明H4的氨基酸序列在約109年間幾乎是恒定的。早在1888年德國化學(xué)家科塞（A.Kossel）已從細胞核中分離出組蛋白，并認識到它們作為堿性物質(zhì)應(yīng)在核中與核酸結(jié)合，但直到1974年才了解組蛋白的確切作用。一些實驗室隨后證明組蛋白以獨特的方式構(gòu)成核小體的組分。
分類和特征
表格中所有數(shù)據(jù)均來自小牛胸腺組蛋白，只有H1例外，其數(shù)據(jù)來自兔組蛋白。
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給組蛋白條目的留言--128.84.124.58 2014年6月10日 (二) 02:22 (CST) 留言：廣告真低級。如何屏蔽呢。 給組蛋白條目的留言--116.231.144.112 2016年3月22日 (二) 15:29 (CST) 留言： 用ADSAFE | |
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