遺傳圖譜
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genetic map
定義:某一物種的染色體圖譜(也就是我們所知的連鎖圖譜),顯示所知的基因和/或遺傳標(biāo)記的相對(duì)位置,而不是在每條染色體上特殊的物理位置。
如果同一條染色體上的兩個(gè)基因相對(duì)距離越長,那么他們減數(shù)分裂發(fā)生重組的概率將越大,共同遺傳的概率也就越小。因此可以根據(jù)他們后代性狀的分離可以判斷他們的交換率,也就可以判斷他們?cè)?strong class="selflink">遺傳圖譜上的相對(duì)距離?! ?/p>
遺傳圖譜可以對(duì)很多的遺傳病進(jìn)行分析
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通過遺傳重組所得到的基因在具體染色體上線性排列圖稱為遺傳連鎖圖。它是通過計(jì)算連鎖的遺傳標(biāo)志之間的重組頻率,確定他們的相對(duì)距離,一般用厘摩(cM,即每次減數(shù)分裂的重組頻率為1%)來表示。繪制遺傳連鎖圖的方法有很多,但是在DNA多態(tài)性技術(shù)未開發(fā)時(shí),鑒定的連鎖圖很少,隨著DNA多態(tài)性的開發(fā),使得可利用的遺傳標(biāo)志數(shù)目迅速擴(kuò)增。早期使用的多態(tài)性標(biāo)志有RFLP(限制性酶切片段長度多態(tài)性)、RAPD(隨機(jī)引物擴(kuò)增多態(tài)性DNA)、AFLP(擴(kuò)增片段長度多態(tài)性);80年代后出現(xiàn)的有STR(短串聯(lián)重復(fù)序列,又稱微衛(wèi)星)DNA遺傳多態(tài)性分析和90年代發(fā)展的SNP(單個(gè)核苷酸的多態(tài)性)分析?! ?/p>
原理
物理圖譜是利用限制性內(nèi)切酶將染色體切成片段,再根據(jù)重疊序列確定片段間連接順序,以及遺傳標(biāo)志之間物理距離〔堿基對(duì)(bp) 或千堿基(kb)或兆堿基(Mb)〕的圖譜。以人類基因組物理圖譜為例,它包括兩層含義,一是獲得分布于整個(gè)基因組30 000個(gè)序列標(biāo)志位點(diǎn)(STS,其定義是染色體定位明確且可用PCR擴(kuò)增的單拷貝序列)。將獲得的目的基因的cDNA克隆,進(jìn)行測序,確定兩端的cDNA序列,約200bp,設(shè)計(jì)合成引物,并分別利用cDNA和基因組DNA作模板擴(kuò)增;比較并純化特異帶;利用STS制備放射性探針與基因組進(jìn)行原位雜交,使每隔100kb就有一個(gè)標(biāo)志;二是在此基礎(chǔ)上構(gòu)建覆蓋每條染色體的大片段:首先是構(gòu)建數(shù)百kb的YAC(酵母人工染色體),對(duì)YAC進(jìn)行作圖,得到重疊的YAC連續(xù)克隆系,被稱為低精度物理作圖,然后在幾十個(gè)kb的DNA片段水平上進(jìn)行,將YAC隨機(jī)切割后裝入粘粒的作圖稱為高精度物理作圖.
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