生物化學(xué)與分子生物學(xué)/轉(zhuǎn)運(yùn)RNA
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生物化學(xué)與分子生物學(xué) |
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tRNA(transfer RNA)是蛋白質(zhì)合成中的接合器分子。tRNA分子有100多種,各可攜帶一種氨基酸,將其轉(zhuǎn)運(yùn)到核蛋白體上,供蛋白質(zhì)合成使用。tRNA是細(xì)胞內(nèi)分子量最小的一類(lèi)核酸,由70~120核苷酸構(gòu)成,各種tRNA無(wú)論在一級(jí)結(jié)構(gòu)上,還是在二、三級(jí)結(jié)構(gòu)上均有一些共同特點(diǎn)。tRNA中含有10%~20%的稀有堿基(rare bases),如:甲基化的嘌呤mG、mA,雙氫尿嘧啶(DHU)、次黃嘌呤等等。此外,tRNA內(nèi)還含有一些稀有核苷,如:胸腺嘧啶核糖核苷,假尿嘧啶核苷(Ψ,pseudouridine)等。胸腺嘧啶一般存在于DNA中;在假尿嘧啶核苷中,不是通常嘧啶環(huán)中1位氮原子,而是嘧啶環(huán)中的5位碳原子與戊糖的1′位碳原子之間形成糖苷鍵。
tRNA分子內(nèi)的核苷酸通過(guò)堿基互補(bǔ)配對(duì)形成多處局部雙螺旋結(jié)構(gòu),未成雙螺旋的區(qū)帶構(gòu)成所謂的環(huán)和襻。現(xiàn)發(fā)現(xiàn)的所有tRNA均可呈現(xiàn)圖15-14所示的這種所謂的三葉草樣(clover leafpattern)二級(jí)結(jié)構(gòu)。在此結(jié)構(gòu)中,從5′末端起的第一個(gè)環(huán)是DHU環(huán),以含二氫尿嘧啶為特征;第二個(gè)環(huán)為反密碼子環(huán),其環(huán)中部的三個(gè)堿基可以與mRNA中的三聯(lián)體密碼子形成堿基互補(bǔ)配對(duì),構(gòu)成所謂的反密碼子(anticodon),在蛋白質(zhì)合成中起解讀密碼子,把正確的氨基酸引入合成位點(diǎn)的作用;第三個(gè)環(huán)為T(mén)Ψ環(huán),以含胸腺核苷和假尿苷為特征;在反密碼子環(huán)與TΨ環(huán)之間,往往存在一個(gè)襻,由數(shù)個(gè)乃至二十余個(gè)核苷酸組成,所有tRNA3′末端均有相同的CCA-OH結(jié)構(gòu),tRNA所轉(zhuǎn)運(yùn)的氨基酸就連接在此末端上。(圖15-14A)
圖15-14 tRNA的二級(jí)與三級(jí)結(jié)構(gòu)
A.二級(jí)結(jié)構(gòu)(a示反密碼環(huán)及反密碼)
B.三級(jí)結(jié)構(gòu)(數(shù)字示可能的非常見(jiàn)核苷酸對(duì)相互作用)
通過(guò)X-射線(xiàn)衍射等結(jié)構(gòu)分析方法,發(fā)現(xiàn)tRNA的共同三級(jí)結(jié)構(gòu)均呈倒L形(圖15-14B),其中3′末端含CCAOH的氨基酸臂位于一端,反密碼子環(huán)位于另一端,DHU環(huán)和TΨ環(huán)雖在二級(jí)結(jié)構(gòu)上各處一方,但在三級(jí)結(jié)構(gòu)上卻相互鄰近。tRNA三級(jí)結(jié)構(gòu)的維系主要是依賴(lài)核苷酸之間形成的各種氫鍵。各種tRNA分子的核苷酸序列和長(zhǎng)度相差較大,但其三級(jí)結(jié)構(gòu)均相似,提示這種空間結(jié)構(gòu)與tRNA的功能有密切關(guān)系。
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