腺病毒
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{{百科小圖片|bkisk.jpg|[[腺病毒]]}}腺病毒(adenovirus)是一種沒有[[包膜]]的直徑為70~90 nm的顆粒,由252個(gè)[[殼粒]]呈廿面體排列構(gòu)成。每個(gè)殼粒的直徑為7~9 nm。衣殼里是線狀雙鏈DNA[[分子]],約含35 000 bp,兩端各有長(zhǎng)約100 bp的[[反向重復(fù)序列]]。由于每條DNA鏈的5'端同相對(duì)分子質(zhì)量為55X103Da的[[蛋白質(zhì)]]分子共價(jià)結(jié)合,可以出現(xiàn)雙鏈DNA的環(huán)狀結(jié)構(gòu)。 ==腺病毒簡(jiǎn)介== 人體腺病毒已知有33種,分別命名為adl~ad33,研究得最詳細(xì)是ad2。腺病毒[[基因組]][[轉(zhuǎn)錄]]產(chǎn)生mRNA,已知的[[轉(zhuǎn)錄單位]]至少有5個(gè):EⅠ區(qū)位于[[病毒基因組]]左側(cè),可再分成EⅠA和EⅠB,與[[細(xì)胞]]轉(zhuǎn)化有關(guān);EⅡ區(qū)編碼DNA[[結(jié)合蛋白]],參與[[病毒]]的復(fù)制;EⅢ區(qū)編碼出現(xiàn)在[[宿主]][[細(xì)胞表面]]的一種[[糖蛋白]];EⅣ區(qū)位于ad2基因組右端,受EⅡ區(qū)編碼的DNA[[結(jié)合蛋白質(zhì)]]調(diào)控;第5個(gè)轉(zhuǎn)錄單位在[[病毒感染]]中期合成ad2蛋白質(zhì)Ⅳ。 腺病毒對(duì)[[嚙齒類動(dòng)物]]有致癌能力,或能[[轉(zhuǎn)化體]]外培養(yǎng)的嚙齒類動(dòng)物細(xì)胞。使細(xì)胞轉(zhuǎn)化只需要腺病毒基因組的一部分,這些[[基因]]位于基因組的左端,約占整個(gè)基因組的7%~10%。盡管腺病毒分布很廣,但對(duì)人體不出現(xiàn)致癌性。人體細(xì)胞是一類[[允許細(xì)胞]](permissive cell),即這類細(xì)胞允許[[感染]]入侵的病毒在細(xì)胞內(nèi)復(fù)制[[增殖]],最后細(xì)胞裂解死亡而釋放出大量[[子代]]病毒。在體外培養(yǎng)的多種人體[[腫瘤細(xì)胞]]中均未查出腺病毒顆粒,但在人的1號(hào)[[染色體]]上有adl2的整合[[位點(diǎn)]],這意味著人體細(xì)胞對(duì)于腺病毒也可能是非允許細(xì)胞,即這類細(xì)胞在病毒感染后,病毒不能在細(xì)胞內(nèi)復(fù)制增殖,但可整合在受感染細(xì)胞的基因組內(nèi)。這些細(xì)胞被病毒轉(zhuǎn)化,[[表型]]發(fā)生改變,且可在體外無限期地培養(yǎng)[[傳代]]。 腺病毒是一種無外殼的雙鏈DNA病毒,基因組長(zhǎng)約36kb,衣殼(capsid)呈規(guī)則的20面體結(jié)構(gòu),直徑約80-110nm。衣殼含有240個(gè)聯(lián)體(hexon)、12個(gè)聯(lián)體(penton)及12根[[纖毛]](fiber),除此之外還有其他一些小[[蛋白]],如VI、VIII、IX、IIIa和IVa2等。六聯(lián)體是形成病毒衣殼20個(gè)三角形面的主要蛋白,12個(gè)頂端是5個(gè)聯(lián)體[[亞單位]]和3個(gè)纖毛蛋白構(gòu)成的[[復(fù)合物]],12根纖毛以五聯(lián)體蛋白為基底由衣殼表面伸出,纖毛頂端形成[[頭節(jié)]]區(qū)(knob)。五聯(lián)體和纖毛的頭節(jié)區(qū)可與細(xì)胞表面的[[病毒受體]]結(jié)合,在病毒感染細(xì)胞過程中起著非常重要的作用。腺病毒的基因組以線性的雙鏈DNA形式存在,由蛋白VII和一種稱為mu的小蛋白緊密地環(huán)繞在其周圍,起到類[[組蛋白]]樣的作用。另一種蛋白V將這種DNA-[[蛋白復(fù)合物]]連接起來,并通過蛋白VI與病毒衣殼連接在一起。在兩條鏈的5′端各以[[共價(jià)鍵]]結(jié)合著一個(gè)被稱為DNA末端蛋白(pTP)復(fù)合物(DNA-TPC)的特化的結(jié)構(gòu),與腺病毒復(fù)制密切相關(guān)。腺病毒基因組的兩端各有一段100bp的反向[[末端重復(fù)]]序列(ITR),是復(fù)制的起始位點(diǎn)。在左端ITR的3′側(cè)有一段長(zhǎng)約300bp的[[包裝信號(hào)]](ψ)介導(dǎo)腺病毒基因組包裝入病毒衣殼。對(duì)腺病毒而言,只有包括兩端的ITR和包裝信號(hào)(ψ)的約0.5kb的序列是[[順式作用元件]],也就是說必須由腺病毒載體自身攜帶,而其他的30余種蛋白都可以通過[[輔助病毒]](或細(xì)胞)反式補(bǔ)足。 ==腺病毒載體的優(yōu)點(diǎn)== ===1. 宿主范圍廣, 對(duì)人[[致病性]]低=== 腺病毒載體系統(tǒng)可廣泛用于人類及非人類蛋白的表達(dá)。腺病毒可感染一系列哺乳動(dòng)物細(xì)胞,因此在大多哺乳動(dòng)物細(xì)胞和組織中均可用來表達(dá)[[重組]]蛋白。特別需要指出的是:腺病毒具有嗜[[上皮細(xì)胞]]性,而人類的大多數(shù)的[[腫瘤]]就是上皮細(xì)胞來源的。另外,腺病毒的[[復(fù)制基因]]和致病基因均已相當(dāng)清楚,在人群中早已流行(70-80%成人體內(nèi)都有腺病毒的[[中和抗體]]存在)。人類感染[[野生型]]腺病毒后僅產(chǎn)生輕微的[[自限性]][[癥狀]],且[[病毒唑]]治療有效?! ?===2. 在增殖和非增殖細(xì)胞中感染和表達(dá)基因=== [[逆轉(zhuǎn)錄病毒]]只能感染增殖性細(xì)胞,因此DNA[[轉(zhuǎn)染]]不能在非增殖細(xì)胞中進(jìn)行,而必須使細(xì)胞處于持續(xù)培養(yǎng)狀態(tài)。腺病毒則能感染幾乎所有的細(xì)胞類型,除了一些抗[[腺病毒感染]]的[[淋巴瘤]]細(xì)胞。腺病毒是研究原代非增殖細(xì)胞[[基因表達(dá)]]的最佳系統(tǒng),它可以使轉(zhuǎn)化細(xì)胞和原代細(xì)胞中得到的結(jié)果直接進(jìn)行對(duì)比?! ?===3. 能有效進(jìn)行增殖,[[滴度]]高=== 腺病毒系統(tǒng)可產(chǎn)生1010到1011VP/ml,濃縮后可達(dá)1013VP/ml,這一特點(diǎn)使它非常適用于[[基因治療]]?! ?===4. 與人類基因[[同源]]=== 腺病毒載體系統(tǒng)一般應(yīng)用人[[類病毒]]作為載體,以人類細(xì)胞作為宿主,因此為人類蛋白進(jìn)行準(zhǔn)確的翻譯后加工和適當(dāng)?shù)恼郫B提供了一個(gè)理想的環(huán)境。大多數(shù)人類蛋白都可達(dá)到高水平表達(dá)并且具有完全的功能?! ?===5. 不整合到染色體中,無插入致突變性=== 逆轉(zhuǎn)錄病毒可[[隨機(jī)整合]]到宿主染色體,導(dǎo)致基因[[失活]]或激活[[癌基因]]。而腺病毒則除了[[卵細(xì)胞]]以外幾乎在所有已知細(xì)胞中都不整合到染色體中,因此不會(huì)干擾其它的宿主基因。在卵細(xì)胞中整合單拷貝病毒則是產(chǎn)生具有特定特征的[[轉(zhuǎn)基因動(dòng)物]]的一個(gè)較好的系統(tǒng)。 ===6. 能在[[懸浮培養(yǎng)]]液中[[擴(kuò)增]]=== 293細(xì)胞可以適應(yīng)懸浮培養(yǎng),這一調(diào)整可使病毒大量擴(kuò)增。大量事實(shí)證明懸浮293細(xì)胞可在1~20L的[[生物反應(yīng)器]]中表達(dá)重組蛋白?! ?===7. 能同時(shí)表達(dá)多個(gè)基因=== 這是第一個(gè)可以在同一[[細(xì)胞株]]或組織中用來設(shè)計(jì)表達(dá)多個(gè)基因的表達(dá)系統(tǒng)。最簡(jiǎn)單的方法是將含有兩個(gè)基因的雙表達(dá)盒插入腺病毒轉(zhuǎn)移載體中,或者用不同的重組病毒[[共轉(zhuǎn)染]]目的細(xì)胞株來分別表達(dá)一個(gè)蛋白。測(cè)定不同重組病毒的MOI比值可正確估計(jì)各重組蛋白的相對(duì)[[共表達(dá)]]情況。 正是由于具有以上一些優(yōu)點(diǎn),腺病毒被極其廣泛地應(yīng)用于體外基因[[轉(zhuǎn)導(dǎo)]]、體內(nèi)[[接種疫苗]]、和基因治療等各個(gè)領(lǐng)域。 ==分類及致病性== 分類及自上個(gè)世紀(jì)50年代發(fā)現(xiàn)并成功分離腺病毒以來,已陸續(xù)發(fā)現(xiàn)了100余個(gè)[[血清型]],其中人腺病毒有47種,分為A、B、C、D、E和F六個(gè)[[亞群]](subgroup)?;蛑委煶S玫娜说?型及5型腺病毒在[[血清學(xué)]]分類上均屬C亞群,在DNA序列上有95%的[[同源性]]。二者的增殖能力非常強(qiáng),滴度通??梢赃_(dá)到109pfu (plaque forming unit)/ml,其在單個(gè)細(xì)胞中的基因組拷貝數(shù)可達(dá)104(約占細(xì)胞總DNA的10%)。病毒顆粒比較穩(wěn)定,通過CsCl[[梯度離心]]可以達(dá)到1010~1011pfu/ml,滿足動(dòng)物實(shí)驗(yàn)的要求。 2型和5型腺病毒的致病性主要表現(xiàn)為可以導(dǎo)致兒童[[上呼吸道感染]]。在感染的最初幾天,由于病毒大量復(fù)制和釋放,會(huì)出現(xiàn)中度[[發(fā)熱]]、渾身酸痛、[[乏力]]、[[咽痛]]等癥狀。但這些癥狀通常是比較短暫而輕微的,在以后的幾天里,會(huì)隨著中和抗體的產(chǎn)生而逐漸消失。雖然可以說高滴度和高免疫原性是腺病毒的主要特點(diǎn),但也是相對(duì)的,如8型腺病毒(主要感染[[小腸]]和[[結(jié)膜]]組織)可以在[[扁桃體]]等[[淋巴組織]]中潛伏下來。在C亞群的其他一些腺病毒中也可以見到同樣的現(xiàn)象,這是因?yàn)椴《镜腅3區(qū)編碼的功能可使其逃避宿主的[[免疫]]打擊。這似乎有助于理解為何腺病毒載體在造血系細(xì)胞中的基因轉(zhuǎn)導(dǎo)效率明顯低于其他組織、細(xì)胞?! ?==腺病毒的生活周期== 腺病毒的生活周期可以分為兩個(gè)截然不同卻又不能割裂開來的兩個(gè)階段。第一階段包括腺病毒顆粒[[粘附]]和進(jìn)入宿主細(xì)胞,將基因組釋放到宿主[[細(xì)胞核]]中,以及有選擇性地轉(zhuǎn)錄和翻譯早期基因。在這個(gè)階段,細(xì)胞為病毒基因組復(fù)制和腺病毒[[晚期]]基因表達(dá)并最終釋放成熟的感染顆粒,即第二階段,作好了準(zhǔn)備。第一階段將在6~8個(gè)小時(shí)內(nèi)完成,第二階段則更快,只需4~6個(gè)小時(shí)?! ?==粘附和進(jìn)入細(xì)胞== 腺病毒感染細(xì)胞的過程是從腺病毒纖毛的頭節(jié)區(qū)粘附到細(xì)胞表面的特異性[[受體]]開始的。因?yàn)槿讼俨《局饕c[[柯薩奇]]B病毒共用一種受體,因此這種受體被稱為柯薩奇/腺病毒受體即CAR(coxsackie/adenovirus receptor)。接下來病毒纖毛基底部五鄰體表面的[[三肽]]RGD與細(xì)胞表面的αvβ3和αvβ5[[整合素]]結(jié)合,通過[[內(nèi)吞作用]]將腺病毒[[內(nèi)化]]到細(xì)胞中并進(jìn)入[[溶酶體]]。在溶酶體的酸性環(huán)境下,腺病毒衣殼的[[構(gòu)象]]將發(fā)生變化,被從溶酶體中釋放出來,躲過溶媒體的[[消化]]作用。最后,腺病毒顆粒轉(zhuǎn)位到細(xì)胞核,通過核孔將病毒DNA釋放到細(xì)胞核內(nèi)。相對(duì)于[[脂質(zhì)體]]轉(zhuǎn)染,腺病毒基因組進(jìn)入細(xì)胞核是一個(gè)非常高效的過程,一般可以達(dá)到40%,前者雖然進(jìn)入[[胞質(zhì)]]的效率與后者相當(dāng),而DNA進(jìn)入細(xì)胞核的效率卻只有前者的1/1000?! ?==轉(zhuǎn)錄與復(fù)制== 一旦病毒基因組進(jìn)入細(xì)胞核,就將進(jìn)行一系列的復(fù)雜而有序的逐級(jí)放大的剪切和轉(zhuǎn)錄過程。一般的,以病毒DNA開始復(fù)制為分界線,按轉(zhuǎn)錄時(shí)間的先后,將腺病毒基因大致區(qū)分為早期(E1~4)和晚期轉(zhuǎn)錄單位(L1~5)。各種腺病毒基因又可以進(jìn)一步地分為更小的轉(zhuǎn)錄單位,如E1區(qū)可以進(jìn)一步分為E1A和E1B,每個(gè)轉(zhuǎn)錄單位都至少有一個(gè)獨(dú)特的[[啟動(dòng)子]]。腺病毒基因組進(jìn)入細(xì)胞核后,細(xì)胞[[轉(zhuǎn)錄因子]]首先與E1A區(qū)上游的[[增強(qiáng)子]]結(jié)合,表達(dá)E1A蛋白,該蛋白的作用是調(diào)節(jié)細(xì)胞[[代謝]],使病毒DNA更易于在細(xì)胞中復(fù)制。E1A蛋白還可以激活其他早期基因(E1B、E2A、E2B、E3和E4)的啟動(dòng)子,其中E2B驅(qū)動(dòng)另外三個(gè)與[[病毒復(fù)制]]有關(guān)的早期基因轉(zhuǎn)錄單位末端[[蛋白前體]](pTP, precursor terminal protein)、[[單鏈]]DNA結(jié)合蛋白(ssDBP, single-stranded DNA binding proteins)以及DNA[[聚合酶]](DNA pol, DNA polymerase)的表達(dá),這三個(gè)基因的表達(dá)產(chǎn)物緊密地結(jié)合成一個(gè)復(fù)合物,與至少三種細(xì)胞蛋白相互作用,啟動(dòng)病毒基因組的復(fù)制。 一般而言,DNA的復(fù)制是由RNA啟動(dòng)的,而在腺病毒卻是所謂的蛋白啟動(dòng)(protein-priming)。如前所述,腺病毒雙鏈DNA的每條單鏈的5′端有pTP蛋白結(jié)合,pTP通過其Ser-OH與DNA 5′端的dCMP 5′[[磷酸]]之間形成磷酸二脂鍵。腺病毒的DNA復(fù)制首先是以5′端結(jié)合有pTP的dCMP作為[[引物]],以3′端的末端反向重復(fù)序列(ITR)為模板,進(jìn)行鏈置換(strand displacement)合成,置換出的單鏈分子可以自我退火環(huán)化,形成鍋柄樣環(huán)形分子,然后這種環(huán)形分子再以相同的機(jī)制合成出子代雙鏈DNA分子。 病毒基因組復(fù)制通常在感染后數(shù)小時(shí)開始,同時(shí)早期基因的轉(zhuǎn)錄和翻譯被關(guān)閉,晚期基因開始表達(dá)。大部分的晚期基因的轉(zhuǎn)錄是以一個(gè)共同的主要晚期啟動(dòng)子(MLP, Major Late Promoter)調(diào)控的。實(shí)際上,MLP的活性與病毒基因組復(fù)制密切相關(guān),有研究表明一旦腺病毒基因組開始復(fù)制MLP的活性將明顯增強(qiáng),對(duì)此我們將另外行文詳述。晚期基因主要編碼腺病毒的[[結(jié)構(gòu)蛋白]]。病毒結(jié)構(gòu)蛋白在細(xì)[[胞核]]內(nèi)聚集形成病毒衣殼,病毒的基因組被包裝進(jìn)去,形成有感染能力的病毒顆粒,并最終裂解宿主細(xì)胞被釋放出去,完成腺病毒的生活周期。腺病毒有明顯的種屬特異性,人的野生型5型腺病毒(wtAd 5)感染其他的非人類細(xì)胞(如鼠類細(xì)胞)后可以表達(dá)早期基因,基因組也可有一定程度的復(fù)制并能夠形成一些不成熟的病毒顆粒,卻不能形成成熟的病毒顆粒,也不能[[二次感染]]其他細(xì)胞?! ?==腺病毒[[基因產(chǎn)物]]的主要功能== ===E1[[區(qū)基因]]表達(dá)產(chǎn)物=== 可以進(jìn)一步分為E1A和E1B。E1A主要由兩種成分構(gòu)成,分別為289R(或13S)和243R(或12S)。這些E1A蛋白的主要功能是調(diào)節(jié)細(xì)胞代謝,使細(xì)胞對(duì)病毒復(fù)制更易感E1B19K與細(xì)胞Bcl-2基因的表達(dá)產(chǎn)物同源,可以通過滅活和清除Bax家族成員來防止細(xì)胞發(fā)生[[凋亡]]或[[壞死]]。E1B55K基因產(chǎn)物可以下調(diào)p53基因的[[轉(zhuǎn)錄水平]],當(dāng)然這種調(diào)節(jié)功能不是絕對(duì)的,其他一些腺病毒基因(如E4 orf6)也參與了這一過程。另外,E1B55K基因產(chǎn)物還與病毒復(fù)制、病毒晚期mRNA的轉(zhuǎn)錄以及病毒RNA的轉(zhuǎn)運(yùn)有關(guān)?! ?===E2區(qū)基因表達(dá)產(chǎn)物=== 可分為E2A和E2B。其中,E2A即DNA結(jié)合蛋白(DBP,DNA Binding Protein);E2B主要產(chǎn)物有兩種,分別是末端蛋白前體(pTP)和病毒DNA聚合酶(pol)。三種蛋白與至少三種細(xì)胞內(nèi)的因子相互作用,啟動(dòng)腺病毒DNA復(fù)制以及病毒晚期基因的轉(zhuǎn)錄和翻譯過程?! ?===E3區(qū)基因表達(dá)產(chǎn)物=== 主要功能是破壞宿主的[[免疫防御]]機(jī)制,而與病毒基因組的復(fù)制無關(guān)。E3基因的產(chǎn)物之一11.6Kd,由于可以在病毒感染的晚期裂解細(xì)胞并釋放病毒顆粒而被稱為腺病毒死亡蛋白(ADP,adenovirus death protein)。gp 19K蛋白可以在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上與MHC I[[類分子]]的[[重鏈]]結(jié)合阻止其轉(zhuǎn)運(yùn)到細(xì)胞表面,并且可以延緩MHC I的表達(dá)。RID α&β以及14.7Kd可以抑制由TNF誘發(fā)的[[細(xì)胞凋亡]],促進(jìn)Fas降解,下調(diào)TNF受體水平。 ===E4區(qū)基因表達(dá)產(chǎn)物=== E4區(qū)的基因產(chǎn)物通常被稱為orf 1~6/7,主要與病毒信使RNA的代謝有關(guān)。還有促進(jìn)病毒DNA復(fù)制以及關(guān)閉宿主[[蛋白合成]]的功能。研究發(fā)現(xiàn),一些E4產(chǎn)物可以與DNA激活的[[蛋白激酶]]結(jié)合,防止病毒DNA發(fā)生串聯(lián)。由于該[[激酶]]可以激活p53基因,因此可以認(rèn)為一些E4區(qū)基因產(chǎn)物可以[[抑制細(xì)胞]]凋亡。許多E1B和E4基因產(chǎn)物都與[[拮抗]]E1A蛋白功能有關(guān)。比如,E4 orf4抑制E1A對(duì)E2F啟動(dòng)子的激活;E4 orf3VA RNA使一些由腺病毒轉(zhuǎn)錄的非翻譯RNA,與腺病毒抵抗宿主[[細(xì)胞免疫]]有關(guān)。 [[分類:微生物]][[分類:病毒]] ==參看== *[[醫(yī)學(xué)微生物學(xué)/腺病毒|《醫(yī)學(xué)微生物學(xué)》- 腺病毒]]
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